生物学论文_2018-2020年中国部分省市猪流行性

文章目录

1 材料与方法

1.1 材料

    1.1.1 样品

    1.1.2 主要试剂及仪器

1.2 方法

    1.2.1 样品处理

    1.2.2 引物设计与合成

    1.2.3 病毒RNA提取与扩增

    1.2.4 PEDV S1基因克隆与测序

    1.2.5 PEDV S1基因序列比对和分析

2 结 果

2.1 2018-2020年11省市猪场PEDV核酸检测结果

2.2 2018-2020年11省市猪场不同季度PEDV核酸检测结果

2.3 PEDV S1基因RT-PCR扩增与测序

2.4 PEDV S1基因序列比对分析

2.5 PEDV S1基因主要抗原位点分析

3 讨 论

4 结 论

文章摘要:【目的】调查中国规模化猪场猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）的流行情况。【方法】利用RT-PCR检测方法对2018-2020年采集于全国11个省市318个规模化猪场的2 391份样品进行PEDV核酸检测,对30份阳性样品进行S1全基因扩增与测序,并利用MegAlign、Mega 7.0等软件进行分析。【结果】2018-2020年,猪场PEDV核酸阳性率分别为48.57%、10.96%和4.72%,样品PEDV核酸阳性率分别为28.97%、8.27%和7.50%,猪场和样品PEDV核酸阳性率呈现逐年下降的趋势。S1基因相似性分析显示,获得的30株毒株全部为GⅡ基因型,其中17株毒株为GⅡa基因亚型、5株毒株为GⅡb亚型、8株毒株为GⅡc亚型,GⅡa基因亚型毒株为2018-2020年流行的主要毒株类型;30株毒株S1基因序列之间核苷酸相似性为93.0%～99.5%,氨基酸相似性为91.7%～100%,其中22株毒株与2017-2018年流行的GⅡ基因型毒株相比S1氨基酸序列表现出特征性插入和缺失。【结论】本研究结果为监测和分析中国PEDV的变异和演化提供了临床数据,为猪流行性腹泻防控和疫苗研制提供了参考。

文章关键词:

论文DOI:10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.02.003

论文分类号:S852.651

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